Если на вашем диске установлено несколько операционных систем, то каждая из них использует один или более разделов. Рассогласования между ними по поводу границ разделов могут привести к катастрофическим последствиям.
MBR содержит таблицу разделов описывающую расположение основных разделов. Данная таблица включает 4 описания , для 4х основных разделов , каждое выглядит таким образом
struct partition {
        char active;    /* 0x80: загрузочный, 0: не загрузочный */
        char begin[3];  /* CHS для первого сектора */
        char type;
        char end[3];    /* CHS для последнего сектора */
        int start;      /* 32 битный номер сектора (считая с 0) */
        int length;     /* 32 битное число , количество секторов */
};
Данная информация несколько избыточна : положение раздела на диске
определяется как 24-битными полями  begin и end ,
и 32 битными полями start и length .
Линукс использует только поля start и length , и поддерживает
партиции содержащие не более 2^32 секторов , т.е. размер раздела
ограничен 2 ТиБ. Это в 100 раз больше чем любой доступный сегодня диск
, и вероятно это лимита хватит на следующие 5-8 лет.
(Хотя разделы и могут быть очень больших размеров, но в тоже время
нужно помнить что максимальный размер файла в ext2 системе 2 ГиБ) 
DOS использует поля begin и end 
и использует сервисы BIOS (Int 13h) для доступа к диску , и поэтому
не может использовать диски более 8.4 ГБ , даже с новым (преобразующим
BIOS). (Разделы не могут быть более 2.1 ГБ , из за ограничений
файловой системы FAT16).  
Windows 95 поддерживает расширенный INT13 интерфейс ,и использует специальные
типа разделов (c,e,f вместо b,6,5) чтобы обозначить что к партиции
нужно обращаться таким образом.При использовании этих типов разделов
, begin и end поля содержат "пустую" информацию ,
(1023/255/63).
Windows 95 OSR2  поддерживает систему FAT32  (типы разделов
b и c),которая позволяет использовать разделы почти 2 ТиБ размером.
Сообщения о перекрывании ('ovelapping') выдаваемые fdisk 
обычно обусловлены тем , что он воспринимает как не корректные поля
begin и end для партиций большего размера.
Проблема не поддается корректировке , т.к. разделы всегда будут 
восприниматься как перекрывающиеся , на дисках с более чем 1024
цилиндрами. 
Просто игнорируйте подобные сообщения , т.к. поля  start и length
все равно содержат корректную информацию. Следует быть осторожным при
использовании fdisk , когда диск используется совместно с DOS, и 
использовать следующий формат вызова команд   cfdisk -Ps /dev/hdx и cfdisk -Pt /dev/hdx
для просмотра таблицы разделов диска  /dev/hdx.