El directori arrel d'un usuari normalment conté tots els fitxers propietat d'aquest usuari. Quan un usuari entra al sistema, se l'emplaça dins del seu directori arrel, i s'executen scripts com ara `.cshrc` o `.profile`.

En crear un usuari nou, Webmin crearà el directori arrel que introdueixis en aquest camp. Si canvies el directori arrel d'un usuari quan el modifiquis, Webmin intentarà canviar el directori si està activada l'opció Desplaça el directori arrel si s'ha canviat.